El templo y los anexos de La Profesa contienen una de las colecciones de óleos de caballete de tipo religioso correspondientes a los siglos XVII, XVIII y XIX, las cuales se distribuyen en cuatro salas: Mariana, Jesuita, Cardenal Newman y Tres siglos. Se trata de más de 453 obras de los más reconocidos artistas de la Nueva España. Fue inaugurada por vez primera como el 26 de mayo de 1978 por el padre Octaviano Valdés, Presidente de la Comisión Arquidiocesana de Arte Sacro. La inauguración definitiva la efectuó el entonces prepósito de la congregación, Antonio Ríos Chávez, el 26 de marzo de 1988, después de largos años de costosas obras de reconstrucción en los salones en que está instalada la Pinacoteca, de las que se hizo cargo el padre Luis Ávila Blancas, miembro integrante de los congregantes oratorios y rector del templo de La Profesa.